Ученые разработали новый метод выявления рака полости рта 07-12-2018 Ученые Бразилии обнаружили связь между прогрессированием рака и обилием специфических белков, присутствующих в опухолевой ткани и слюне. Это открытие поможет при распознавании плоскоклеточного рака полости рта на ранней стадии.
"Мы работали над исследованием в течение пяти лет, пока не достигли этого прорыва", - говорит Адриана Франко Паес Леме, научный сотрудник Бразильской Бионаучной Лаборатории, входящей в состав Национального Исследовательского Центра Энергетики и Материалов в Сан-Паулу.
На первом этапе исследования исследователи использовали лазерную микродиссекцию и протеомику для картирования белков в ткани рака полости рта и корреляции их с клиническими характеристиками пациентов. Этот анализ позволил выявить ряд белков, таких как CSTB, NDRG1, LTA4H, PGK1, COL6A1, ITGAV и MB – разной численности в зависимости от локализации опухоли, и связать их с основными клиническими результатами.
На втором этапе исследования, после идентификации и количественной оценки белков примерно в 120 образцах опухолевой ткани, исследователи применили две стратегии проверки белка. "Одна стратегия состояла в измерении обилия отобранных белков в независимых образцах тканей с использованием иммуногистохимии с антителами. Другая состояла в мониторинге тех же предварительно выбранных белков в слюне пациентов", - пояснила Паес Леме.
"Слюна является перспективным источником маркеров, а также жидкостью, получаемой неинвазивным способом", - пояснила она. "Мы проверили белки в слюне 40% пациентов. Технически трижды проанализировали результаты для достижения максимальной достоверности на этом этапе исследования".
После анализа образцов слюны исследователи использовали методы биоинформатики и машинного обучения для получения прогнозируемых признаков заболевания. Затем они смогли проверить, какие из белков или пептидов были выбраны во время первого этапа, и тем самым смогли различить пациентов, которые имели или не имели цервикальный метастаз лимфатического узла.
По результатам исследования удалось выявить три специфических пептида-LTA4H, COL6A1 и CSTB, которые могут быть использованы в качестве сигнатуры для классификации пациентов с метастазами шейных лимфатических узлов и без них. Исследователи считают, что это может потенциально помочь врачам преодолеть ограничения клинических обследований и разрабатывать индивидуальные стратегии лечения.
"Полученные данные привели к надежным результатам, которые в перспективе можно использовать в качестве справочной литературы при определении серьезности заболевания. Мы предложили потенциальные маркеры заболевания на первом этапе исследования и проверили эти маркеры на втором этапе. Подтвержденная надежность полученных данных показала, что эти маркеры эффективны при классификации пациентов с метастазами шейных лимфатических узлов”, - сказал Паес Леме.
В настоящее время ученые работают над новым исследованием, которое поможет создать доступные биодатчики, способные обнаруживать предвещающие заболевание признаки в слюне пациента.